Phim Vượt Ngục (Phần 2) kể về việc sau khi trốn thoát khỏi nhà tù ngoài việc bị cảnh sát truy đuổi gay cấn thì còn có một đặc vụ liên bang tên là Alexander Mahone được giao nhiệm vụ săn bắt lại các tù nhân này. Tuy nhiên, anh ta rơi vào một mớ hỗn độn khi bị phát hiện rằng mình đang làm việc cho The Company, một tổ chức bí ẩn với những âm mưu phức tạp. [Xem thêm]